微量細胞或DNA簡化基因組甲基化測序（ Micro DNA-XRBS）
與常規(guī)RRBS不同，高通量單細胞甲基化測序sc-RBS由于從單個細胞輸入的DNA量很少，常規(guī)方法不能保證目標DNA在最后的擴增過程中保持不變，因此sc-RBS在降損方面進行細化。易基因建立的高通量單細胞甲基化測序sc-RBS技術無需純化，通過限制性內(nèi)切酶消化、接頭連接過程和在單管中轉(zhuǎn)化重亞硫酸鹽，是一種專注于將純化過程中發(fā)生的損失降至最低的方法。
應用方向
5、性價比高：單個細胞檢測費用低至千余元。
技術路線
實驗策略
分析內(nèi)容
送樣要求
技術指標
經(jīng)典案例
sc-RBS+RNA-seq測序揭示黃曲霉毒素B1誘導S期阻滯L02細胞肝毒性新機制
Single-cell sequencing reveals novel mechanisms of Aflatoxin B1-induced hepatotoxicity in S phase-arrested L02 cells
1.背景：
大量研究證據(jù)表明黃曲霉毒素B1（Aflatoxin B1 ,AFB1）誘導的毒性包括抑制細胞增殖、氧化應激、DNA損傷、細胞周期阻滯和細胞凋亡，特別是針對肝臟細胞具有強烈的毒性。但AFB1毒性的表觀遺傳機制目前尚不清楚，需要進一步探討。
2.方法：
本研究通過單細胞測序技術（scRNA-seq + sc-RRBS）研究AFB1誘導S期阻滯L02細胞肝毒性機制。
3.結論：
單細胞測序技術結果發(fā)現(xiàn)AFB1可誘導細胞凋亡和細胞周期S期阻滯，降低線粒體膜電位(ΔΨm)，增加活性氧(ROS)生成。通過促性腺激素釋放激素受體通路，Wnt信號傳導通路，TGF-β信號通路等調(diào)節(jié)DNA甲基化水平。研究結果揭示了AFB1對S期阻滯L02細胞誘導的肝毒性機制，其中DNA甲基化通過調(diào)控促性腺激素釋放激素受體通路、Wnt信號傳導通路和TGF-β信號通路發(fā)揮作用，為進一步研究精確毒理學提供了新的探索策略，包括靶細胞選擇、多組非定向測序和通路分析。
圖：基于單細胞測序結果，研究人員提出AFB1誘導的S期阻滯L02細胞肝毒性調(diào)節(jié)機制的假設
